高校生活初日。友達が出来るか不安を抱きながら登校した水城 姫華は、机の中に差出人不明の謎解きゲームの挑戦状が入っているのを発見する。　挑戦状は一組全員に配布されており、全ての謎を解くと「入学祝い」が貰える主旨が書かれていた。水城は近くの席の鈴堂 風雅、廻立 夕陽と協力しながら、手掛かりを頼りに謎を解いていく。　新しい学校、新しい制服、新しいクラスメート――。新生活に対するそれぞれの思いが交錯しながら、謎解きは一組の前に立ちはだかる。