熊本市内の私立高校に通う平凡な少年、米島涼（よねしまりょう）は兄を亡くしたことをきっかけに楽しかった幼少の思い出を犠牲にして中学時代の辛い記憶を意図的に忘れ、友人の土谷大地（つちやだいち）と彼の幼馴染である木崎美紀（きさきみのり）と平穏であるが同時に退屈で怠惰な日々を過ごしていた。　そして一年の文化祭後のある日、転校生の美少女――草原葵（くさはらあおい）がやってきてクラス中が色めきたつ中、涼は卑屈に構えていた。　しかし、ひょんなことから涼は草原葵と付き合うことになり、学校の生徒の間だけに秘密裏に受け継がれてきた秘密結社エーデルワイス団の存在が、涼の青春と運命を大きく変えるのだった。